Tabela 3. Modele substytucji nukleotydów (według Nei i Kumar, 2000; zmienione).


A

T

C

G

A

T

C

G


model JC69

model T92

A

α

α

α

βθ2

βθ1

αθ1

T

α

α

α

βθ2

αθ1

βθ1

C

α

α

α

βθ2

αθ2

βθ1

G

α

α

α

αθ2

βθ2

βθ1


model K2P

model HKY

A

β

β

α

βgT

βgC

αgG

T

β

α

β

βgA

αgC

βgG

C

β

α

β

βgA

αgT

βgG

G

α

β

β

αgA

βgT

βgC


model F81

model GTR

A

αgT

αgC

αgG

agT

bgC

cgC

T

αgA

αgC

αgG

agA

dgC

egC

C

αgA

αgT

αgG

bgA

dgT

fgC

G

αgA

αgT

αgC

cgA

egT

fgC

Oznaczenia: gA, gT, gC i gG oznaczają częstość nukleotydów; θ1 = gG + gC; θ2 = gA + gT;